Reorganization
- All garlic stuff is moved into garlic/ - Group the overlay index by sections - Add a garlic/default.nix link to the main default.nix, so we can build derivations at garlic/
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parent
a8db596b35
commit
9a0ea08d72
55
garlic/apps/index.nix
Normal file
55
garlic/apps/index.nix
Normal file
@ -0,0 +1,55 @@
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|||||||
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{
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super
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||||||
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, self
|
||||||
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, bsc
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||||||
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, garlic
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||||||
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, callPackage
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||||||
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}:
|
||||||
|
|
||||||
|
{
|
||||||
|
nbody = callPackage ./nbody/default.nix {
|
||||||
|
gitBranch = "garlic/seq";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
saiph = callPackage ./saiph/default.nix {
|
||||||
|
cc = bsc.clangOmpss2;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
creams = callPackage ./creams/default.nix {
|
||||||
|
gnuDef = self.gfortran10 ; # Default GNU compiler version
|
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intelDef = bsc.icc ; # Default Intel compiler version
|
||||||
|
gitBranch = "garlic/mpi+send+seq";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
creamsInput = callPackage ./creams/input.nix {
|
||||||
|
gitBranch = "garlic/mpi+send+seq";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
hpcg = callPackage ./hpcg/default.nix {
|
||||||
|
gitBranch = "garlic/oss";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
bigsort = {
|
||||||
|
sort = callPackage ./bigsort/default.nix {
|
||||||
|
gitBranch = "garlic/mpi+send+omp+task";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
genseq = callPackage ./bigsort/genseq.nix { };
|
||||||
|
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||||||
|
shuffle = callPackage ./bigsort/shuffle.nix { };
|
||||||
|
};
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||||||
|
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||||||
|
heat = callPackage ./heat/default.nix { };
|
||||||
|
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||||||
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miniamr = callPackage ./miniamr/default.nix {
|
||||||
|
variant = "ompss-2";
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};
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||||||
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||||||
|
ifsker = callPackage ./ifsker/default.nix { };
|
||||||
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||||||
|
lulesh = callPackage ./lulesh/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
hpccg = callPackage ./hpccg/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
fwi = callPackage ./fwi/default.nix { };
|
||||||
|
}
|
||||||
1
garlic/default.nix
Normal file
1
garlic/default.nix
Normal file
@ -0,0 +1 @@
|
|||||||
|
import ../default.nix
|
||||||
40
garlic/ds/index.nix
Normal file
40
garlic/ds/index.nix
Normal file
@ -0,0 +1,40 @@
|
|||||||
|
{
|
||||||
|
super
|
||||||
|
, self
|
||||||
|
, bsc
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||||||
|
, garlic
|
||||||
|
, callPackage
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
with garlic.pp;
|
||||||
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|
||||||
|
let
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||||||
|
exp = garlic.exp;
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||||||
|
in
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||||||
|
{
|
||||||
|
nbody = with exp.nbody; {
|
||||||
|
baseline = merge [ baseline ];
|
||||||
|
small = merge [ small ];
|
||||||
|
jemalloc = merge [ baseline jemalloc ];
|
||||||
|
#freeCpu = merge [ baseline freeCpu ];
|
||||||
|
ctf = merge [ ctf ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
hpcg = with exp.hpcg; {
|
||||||
|
oss = merge [ oss ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
saiph = with exp.saiph; {
|
||||||
|
numcomm = merge [ numcomm ];
|
||||||
|
granularity = merge [ granularity ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
heat = with exp.heat; {
|
||||||
|
test = merge [ test ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
creams = with exp.creams.ss; {
|
||||||
|
ss.hybrid = merge [ hybrid ];
|
||||||
|
ss.pure = merge [ pure ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
93
garlic/exp/index.nix
Normal file
93
garlic/exp/index.nix
Normal file
@ -0,0 +1,93 @@
|
|||||||
|
{
|
||||||
|
super
|
||||||
|
, self
|
||||||
|
, bsc
|
||||||
|
, garlic
|
||||||
|
, callPackage
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
{
|
||||||
|
nbody = rec {
|
||||||
|
baseline = callPackage ./nbody/nblocks.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Experiment variants
|
||||||
|
small = baseline.override {
|
||||||
|
particles = 12 * 4096;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
# TODO: Update freeCpu using a non-standard pipeline
|
||||||
|
#freeCpu = baseline.override { freeCpu = true; };
|
||||||
|
jemalloc = baseline.override { enableJemalloc = true; };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Some experiments with traces
|
||||||
|
trace = {
|
||||||
|
# Only one unit repeated 30 times
|
||||||
|
baseline = small.override {
|
||||||
|
enableCTF = true;
|
||||||
|
loops = 30;
|
||||||
|
steps = 1;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Same but with jemalloc enabled
|
||||||
|
jemalloc = trace.baseline.override {
|
||||||
|
enableJemalloc = true;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
saiph = {
|
||||||
|
numcomm = callPackage ./saiph/numcomm.nix { };
|
||||||
|
granularity = callPackage ./saiph/granularity.nix { };
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
creams = {
|
||||||
|
ss = {
|
||||||
|
pure = callPackage ./creams/ss+pure.nix { };
|
||||||
|
hybrid = callPackage ./creams/ss+hybrid.nix { };
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
hpcg = rec {
|
||||||
|
#serial = callPackage ./hpcg/serial.nix { };
|
||||||
|
#mpi = callPackage ./hpcg/mpi.nix { };
|
||||||
|
#omp = callPackage ./hpcg/omp.nix { };
|
||||||
|
#mpi_omp = callPackage ./hpcg/mpi+omp.nix { };
|
||||||
|
#input = callPackage ./hpcg/gen.nix {
|
||||||
|
# inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
||||||
|
#};
|
||||||
|
genInput = callPackage ./hpcg/gen.nix {
|
||||||
|
inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
oss = callPackage ./hpcg/oss.nix {
|
||||||
|
inherit genInput;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
heat = {
|
||||||
|
test = callPackage ./heat/test.nix { };
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
bigsort = rec {
|
||||||
|
genseq = callPackage ./bigsort/genseq.nix {
|
||||||
|
n = toString (1024 * 1024 * 1024 / 8); # 1 GB input size
|
||||||
|
dram = toString (1024 * 1024 * 1024); # 1 GB chunk
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
shuffle = callPackage ./bigsort/shuffle.nix {
|
||||||
|
inputTre = genseq;
|
||||||
|
n = toString (1024 * 1024 * 1024 / 8); # 1 GB input size
|
||||||
|
dram = toString (1024 * 1024 * 1024); # 1 GB chunk
|
||||||
|
inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
sort = callPackage ./bigsort/sort.nix {
|
||||||
|
inputTre = shuffle;
|
||||||
|
inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
||||||
|
removeOutput = false;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
slurm = {
|
||||||
|
cpu = callPackage ./slurm/cpu.nix { };
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
57
garlic/fig/index.nix
Normal file
57
garlic/fig/index.nix
Normal file
@ -0,0 +1,57 @@
|
|||||||
|
{
|
||||||
|
super
|
||||||
|
, self
|
||||||
|
, bsc
|
||||||
|
, garlic
|
||||||
|
, callPackage
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
let
|
||||||
|
rPlot = garlic.pp.rPlot;
|
||||||
|
ds = garlic.ds;
|
||||||
|
in
|
||||||
|
{
|
||||||
|
nbody = {
|
||||||
|
baseline = rPlot {
|
||||||
|
script = ./nbody/baseline.R;
|
||||||
|
dataset = ds.nbody.baseline;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
small = rPlot {
|
||||||
|
script = ./nbody/baseline.R;
|
||||||
|
dataset = ds.nbody.small;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
jemalloc = rPlot {
|
||||||
|
script = ./nbody/jemalloc.R;
|
||||||
|
dataset = ds.nbody.jemalloc;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
#freeCpu = rPlot {
|
||||||
|
# script = ./nbody/freeCpu.R;
|
||||||
|
# dataset = ds.nbody.freeCpu;
|
||||||
|
#};
|
||||||
|
ctf = rPlot {
|
||||||
|
script = ./nbody/baseline.R;
|
||||||
|
dataset = ds.nbody.ctf;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
hpcg = {
|
||||||
|
oss = with ds.hpcg; rPlot {
|
||||||
|
script = ./hpcg/oss.R;
|
||||||
|
dataset = oss;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
saiph = {
|
||||||
|
granularity = with ds.saiph; rPlot {
|
||||||
|
script = ./saiph/granularity.R;
|
||||||
|
dataset = granularity;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
heat = {
|
||||||
|
test = with ds.heat; rPlot {
|
||||||
|
script = ./heat/test.R;
|
||||||
|
dataset = test;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
128
garlic/index.nix
Normal file
128
garlic/index.nix
Normal file
@ -0,0 +1,128 @@
|
|||||||
|
{
|
||||||
|
super
|
||||||
|
, self
|
||||||
|
, bsc
|
||||||
|
, callPackage
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
{
|
||||||
|
unsafeDevelop = callPackage ./develop/default.nix {
|
||||||
|
extraInputs = with self; [
|
||||||
|
coreutils htop procps-ng vim which strace
|
||||||
|
tmux gdb kakoune universal-ctags bashInteractive
|
||||||
|
glibcLocales ncurses git screen curl
|
||||||
|
# Add more nixpkgs packages here...
|
||||||
|
bsc.slurm bsc.clangOmpss2 bsc.icc bsc.mcxx bsc.perf
|
||||||
|
# Add more bscpkgs packages here...
|
||||||
|
];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
develop = bsc.garlic.stages.exec rec {
|
||||||
|
nextStage = bsc.garlic.stages.isolate {
|
||||||
|
nextStage = bsc.garlic.unsafeDevelop;
|
||||||
|
nixPrefix = bsc.garlic.targetMachine.config.nixPrefix;
|
||||||
|
extraMounts = [ "/tmp:$TMPDIR" ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
nixPrefix = bsc.garlic.targetMachine.config.nixPrefix;
|
||||||
|
# This hack uploads all dependencies to MN4
|
||||||
|
pre = let
|
||||||
|
nixPrefix = bsc.garlic.targetMachine.config.nixPrefix;
|
||||||
|
stageProgram = bsc.garlicTools.stageProgram;
|
||||||
|
in
|
||||||
|
''
|
||||||
|
# Hack to upload this to MN4: @upload-to-mn@
|
||||||
|
|
||||||
|
# Create a link to the develop script
|
||||||
|
ln -fs ${nixPrefix}${stageProgram nextStage} .nix-develop
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
post = "\n";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Configuration for the machines
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||||||
|
machines = callPackage ./machines.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
report = callPackage ./report.nix {
|
||||||
|
fig = bsc.garlic.fig;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
sedReport = callPackage ./sedReport.nix {
|
||||||
|
fig = bsc.garlic.fig;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
bundleReport = callPackage ./bundleReport.nix {
|
||||||
|
fig = bsc.garlic.fig;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
reportTar = callPackage ./reportTar.nix {
|
||||||
|
fig = bsc.garlic.fig;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Use the configuration for the following target machine
|
||||||
|
targetMachine = bsc.garlic.machines.mn4;
|
||||||
|
|
||||||
|
# Load some helper functions to generate app variants
|
||||||
|
|
||||||
|
stdexp = callPackage ./stdexp.nix {
|
||||||
|
inherit (bsc.garlic) targetMachine stages;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Execution stages
|
||||||
|
stages = {
|
||||||
|
sbatch = callPackage ./stages/sbatch.nix { };
|
||||||
|
srun = callPackage ./stages/srun.nix { };
|
||||||
|
control = callPackage ./stages/control.nix { };
|
||||||
|
exec = callPackage ./stages/exec.nix { };
|
||||||
|
extrae = callPackage ./stages/extrae.nix { };
|
||||||
|
valgrind = callPackage ./stages/valgrind.nix { };
|
||||||
|
perf = callPackage ./stages/perf.nix { };
|
||||||
|
isolate = callPackage ./stages/isolate { };
|
||||||
|
runexp = callPackage ./stages/runexp { };
|
||||||
|
trebuchet = callPackage ./stages/trebuchet.nix { };
|
||||||
|
strace = callPackage ./stages/strace.nix { };
|
||||||
|
unit = callPackage ./stages/unit.nix { };
|
||||||
|
experiment = callPackage ./stages/experiment.nix { };
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Tests (move to bsc ?)
|
||||||
|
mpptest = callPackage ./mpptest { };
|
||||||
|
|
||||||
|
ppong = callPackage ./ppong {
|
||||||
|
mpi = bsc.mpi;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
hist = callPackage ./pp/hist { };
|
||||||
|
|
||||||
|
tool = callPackage ./sh/default.nix {
|
||||||
|
sshHost = "mn1";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Post processing tools
|
||||||
|
pp = with bsc.garlicTools; rec {
|
||||||
|
store = callPackage ./pp/store.nix { };
|
||||||
|
resultFromTrebuchet = trebuchetStage: (store {
|
||||||
|
experimentStage = getExperimentStage trebuchetStage;
|
||||||
|
inherit trebuchetStage;
|
||||||
|
});
|
||||||
|
timetable = callPackage ./pp/timetable.nix { };
|
||||||
|
rPlot = callPackage ./pp/rplot.nix { };
|
||||||
|
timetableFromTrebuchet = tre: timetable (resultFromTrebuchet tre);
|
||||||
|
mergeDatasets = callPackage ./pp/merge.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Takes a list of experiments and returns a file that contains
|
||||||
|
# all timetable results from the experiments.
|
||||||
|
merge = exps: mergeDatasets (map timetableFromTrebuchet exps);
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# Apps for Garlic
|
||||||
|
apps = callPackage ./apps/index.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Experiments
|
||||||
|
exp = callPackage ./exp/index.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Datasets used in the figures
|
||||||
|
ds = callPackage ./ds/index.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Figures generated from the experiments
|
||||||
|
fig = callPackage ./fig/index.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
624
overlay.nix
624
overlay.nix
@ -6,59 +6,37 @@ with self.lib;
|
|||||||
let
|
let
|
||||||
inherit (self.lib) callPackageWith;
|
inherit (self.lib) callPackageWith;
|
||||||
inherit (self.lib) callPackagesWith;
|
inherit (self.lib) callPackagesWith;
|
||||||
callPackage = callPackageWith (self // self.bsc // self.garlic);
|
callPackage = callPackageWith (self // self.bsc // self.bsc.garlic);
|
||||||
|
|
||||||
appendPasstru = drv: attrs: drv.overrideAttrs (old:{
|
appendPasstru = drv: attrs: drv.overrideAttrs (old:{
|
||||||
passthru = old.passthru // attrs;
|
passthru = old.passthru // attrs;
|
||||||
});
|
});
|
||||||
|
|
||||||
# --------------------------------------------------------- #
|
# ===================================================================
|
||||||
# BSC Packages
|
# BSC Packages
|
||||||
# --------------------------------------------------------- #
|
# ===================================================================
|
||||||
|
|
||||||
_bsc = makeExtensible (bsc: {
|
_bsc = makeExtensible (bsc: {
|
||||||
# Default MPI implementation to use. Will be overwritten by the
|
|
||||||
|
inherit callPackage;
|
||||||
|
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
# Compilers
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
|
||||||
|
# Default C (and C++) compiler to use. It will be overwritten by the
|
||||||
# experiments.
|
# experiments.
|
||||||
mpi = bsc.impi;
|
cc = bsc.icc;
|
||||||
|
|
||||||
perf = callPackage ./bsc/perf/default.nix {
|
|
||||||
kernel = self.linuxPackages_4_9.kernel;
|
|
||||||
systemtap = self.linuxPackages_4_9.systemtap;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
# ParaStation MPI
|
|
||||||
pscom = callPackage ./bsc/parastation/pscom.nix { };
|
|
||||||
psmpi = callPackage ./bsc/parastation/psmpi.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
osumb = callPackage ./bsc/osu/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
mpich = callPackage ./bsc/mpich/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
mpichDebug = bsc.mpich.override { enableDebug = true; };
|
|
||||||
|
|
||||||
# Updated version of libpsm2: TODO push upstream.
|
|
||||||
#libpsm2 = callPackage ./bsc/libpsm2/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
# Default Intel MPI version is 2019 (the last one)
|
|
||||||
impi = bsc.intelMpi;
|
|
||||||
|
|
||||||
intelMpi = bsc.intelMpi2019;
|
|
||||||
|
|
||||||
intelMpi2019 = callPackage ./bsc/intel-mpi/default.nix {
|
|
||||||
# Intel MPI provides a debug version of the MPI library, but
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|
||||||
# by default we use the release variant for performance
|
|
||||||
enableDebug = false;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
# By default we use Intel compiler 2020 update 1
|
# By default we use Intel compiler 2020 update 1
|
||||||
|
intelLicense = callPackage ./bsc/intel-compiler/license.nix { };
|
||||||
iccUnwrapped = bsc.icc2020Unwrapped;
|
iccUnwrapped = bsc.icc2020Unwrapped;
|
||||||
|
|
||||||
icc2020Unwrapped = callPackage ./bsc/intel-compiler/icc2020.nix {
|
icc2020Unwrapped = callPackage ./bsc/intel-compiler/icc2020.nix {
|
||||||
intel-mpi = bsc.intelMpi;
|
intel-mpi = bsc.intelMpi;
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
# A wrapper script that puts all the flags and environment vars properly and
|
# A wrapper script that puts all the flags and environment vars
|
||||||
# calls the intel compiler binary
|
# properly and calls the intel compiler binary
|
||||||
icc = appendPasstru (callPackage ./bsc/intel-compiler/default.nix {
|
icc = appendPasstru (callPackage ./bsc/intel-compiler/default.nix {
|
||||||
iccUnwrapped = bsc.iccUnwrapped;
|
iccUnwrapped = bsc.iccUnwrapped;
|
||||||
intelLicense = bsc.intelLicense;
|
intelLicense = bsc.intelLicense;
|
||||||
@ -68,88 +46,6 @@ let
|
|||||||
# determine the name of the compiler
|
# determine the name of the compiler
|
||||||
gcc = appendPasstru self.gcc { CC = "gcc"; CXX = "g++"; };
|
gcc = appendPasstru self.gcc { CC = "gcc"; CXX = "g++"; };
|
||||||
|
|
||||||
intelLicense = callPackage ./bsc/intel-compiler/license.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
pmix2 = callPackage ./bsc/pmix/pmix2.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
slurm17 = callPackage ./bsc/slurm/default.nix {
|
|
||||||
pmix = bsc.pmix2;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
slurm17-libpmi2 = callPackage ./bsc/slurm/pmi2.nix {
|
|
||||||
pmix = bsc.pmix2;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
# Use a slurm compatible with MN4
|
|
||||||
slurm = bsc.slurm17;
|
|
||||||
|
|
||||||
openmpi-mn4 = callPackage ./bsc/openmpi/default.nix {
|
|
||||||
pmix = bsc.pmix2;
|
|
||||||
pmi2 = bsc.slurm17-libpmi2;
|
|
||||||
enableCxx = true;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
openmpi = bsc.openmpi-mn4;
|
|
||||||
|
|
||||||
fftw = callPackage ./bsc/fftw/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
otf = callPackage ./bsc/otf/default.nix { };
|
|
||||||
vite = self.qt5.callPackage ./bsc/vite/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
wxpropgrid = callPackage ./bsc/wxpropgrid/default.nix { };
|
|
||||||
paraver = callPackage ./bsc/paraver/default.nix { };
|
|
||||||
paraverExtra = bsc.paraver.override { enableMouseLabel = true; };
|
|
||||||
paraverDebug = bsc.paraver.overrideAttrs (old:
|
|
||||||
{
|
|
||||||
dontStrip = true;
|
|
||||||
enableDebugging = true;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
extrae = callPackage ./bsc/extrae/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
tampi = bsc.tampiRelease;
|
|
||||||
tampiRelease = callPackage ./bsc/tampi/default.nix { };
|
|
||||||
tampiGit = callPackage ./bsc/tampi/git.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
mcxx = bsc.mcxxRelease;
|
|
||||||
mcxxRelease = callPackage ./bsc/mcxx/default.nix { };
|
|
||||||
mcxxRarias = callPackage ./bsc/mcxx/rarias.nix {
|
|
||||||
bison = self.bison_3_5;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
nanos6 = bsc.nanos6Release;
|
|
||||||
nanos6Release = callPackage ./bsc/nanos6/default.nix { };
|
|
||||||
nanos6Git = callPackage ./bsc/nanos6/git.nix { };
|
|
||||||
nanos6Debug = bsc.nanos6.overrideAttrs (old: {
|
|
||||||
dontStrip = true;
|
|
||||||
enableDebugging = true;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
jemalloc = self.jemalloc.overrideAttrs (old:
|
|
||||||
{
|
|
||||||
# Custom nanos6 configure options
|
|
||||||
configureFlags = old.configureFlags ++ [
|
|
||||||
"--with-jemalloc-prefix=nanos6_je_"
|
|
||||||
"--enable-stats"
|
|
||||||
];
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
nanos6Jemalloc = bsc.nanos6.override {
|
|
||||||
enableJemalloc = true;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
babeltrace = callPackage ./bsc/babeltrace/default.nix { };
|
|
||||||
babeltrace2 = callPackage ./bsc/babeltrace2/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
vtk = callPackage ./bsc/vtk/default.nix {
|
|
||||||
inherit (self.xorg) libX11 xorgproto libXt;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
dummy = callPackage ./bsc/dummy/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
# Our custom version that lacks the binaries. Disabled by default.
|
|
||||||
#rdma-core = callPackage ./bsc/rdma-core/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
# Last llvm release by default
|
# Last llvm release by default
|
||||||
llvmPackages = self.llvmPackages_11 // {
|
llvmPackages = self.llvmPackages_11 // {
|
||||||
clang = appendPasstru self.llvmPackages_11.clang {
|
clang = appendPasstru self.llvmPackages_11.clang {
|
||||||
@ -161,30 +57,139 @@ let
|
|||||||
|
|
||||||
clangOmpss2Unwrapped = callPackage ./bsc/llvm-ompss2/clang.nix {
|
clangOmpss2Unwrapped = callPackage ./bsc/llvm-ompss2/clang.nix {
|
||||||
stdenv = bsc.llvmPackages.stdenv;
|
stdenv = bsc.llvmPackages.stdenv;
|
||||||
enableDebug = false;
|
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
clangOmpss2 = appendPasstru (callPackage bsc/llvm-ompss2/default.nix {
|
clangOmpss2 = appendPasstru (
|
||||||
|
callPackage ./bsc/llvm-ompss2/default.nix {
|
||||||
clangOmpss2Unwrapped = bsc.clangOmpss2Unwrapped;
|
clangOmpss2Unwrapped = bsc.clangOmpss2Unwrapped;
|
||||||
}) { CC = "clang"; CXX = "clang++"; };
|
}) { CC = "clang"; CXX = "clang++"; };
|
||||||
|
|
||||||
stdenvOmpss2 = self.clangStdenv.override {
|
mcxx = bsc.mcxxRelease;
|
||||||
cc = bsc.clangOmpss2;
|
mcxxRelease = callPackage ./bsc/mcxx/default.nix { };
|
||||||
|
mcxxRarias = callPackage ./bsc/mcxx/rarias.nix {
|
||||||
|
bison = self.bison_3_5;
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
cpic = callPackage ./bsc/apps/cpic/default.nix {
|
# =================================================================
|
||||||
stdenv = bsc.stdenvOmpss2;
|
# nanos6
|
||||||
mpi = bsc.mpi;
|
# =================================================================
|
||||||
tampi = bsc.tampi;
|
nanos6 = bsc.nanos6Release;
|
||||||
|
nanos6Release = callPackage ./bsc/nanos6/default.nix { };
|
||||||
|
nanos6Git = callPackage ./bsc/nanos6/git.nix { };
|
||||||
|
nanos6Debug = bsc.nanos6.overrideAttrs (old: {
|
||||||
|
dontStrip = true;
|
||||||
|
enableDebugging = true;
|
||||||
|
});
|
||||||
|
nanos6Jemalloc = bsc.nanos6.override { enableJemalloc = true; };
|
||||||
|
|
||||||
|
jemalloc = self.jemalloc.overrideAttrs (old:
|
||||||
|
{
|
||||||
|
# Custom nanos6 configure options
|
||||||
|
configureFlags = old.configureFlags ++ [
|
||||||
|
"--with-jemalloc-prefix=nanos6_je_"
|
||||||
|
"--enable-stats"
|
||||||
|
];
|
||||||
|
});
|
||||||
|
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
# MPI
|
||||||
|
# =================================================================
|
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||||||
|
# Default MPI implementation to use. Will be overwritten by the
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||||||
|
# experiments.
|
||||||
|
mpi = bsc.impi;
|
||||||
|
|
||||||
|
# ParaStation MPI
|
||||||
|
pscom = callPackage ./bsc/parastation/pscom.nix { };
|
||||||
|
psmpi = callPackage ./bsc/parastation/psmpi.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# MPICH
|
||||||
|
mpich = callPackage ./bsc/mpich/default.nix { };
|
||||||
|
mpichDebug = bsc.mpich.override { enableDebug = true; };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Default Intel MPI version is 2019 (the last one)
|
||||||
|
impi = bsc.intelMpi;
|
||||||
|
intelMpi = bsc.intelMpi2019;
|
||||||
|
intelMpi2019 = callPackage ./bsc/intel-mpi/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# OpenMPI
|
||||||
|
openmpi = bsc.openmpi-mn4;
|
||||||
|
openmpi-mn4 = callPackage ./bsc/openmpi/default.nix {
|
||||||
|
pmix = bsc.pmix2;
|
||||||
|
pmi2 = bsc.slurm17-libpmi2;
|
||||||
|
enableCxx = true;
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
mpptest = callPackage ./bsc/mpptest/default.nix { };
|
# TAMPI
|
||||||
|
tampi = bsc.tampiRelease;
|
||||||
|
tampiRelease = callPackage ./bsc/tampi/default.nix { };
|
||||||
|
tampiGit = callPackage ./bsc/tampi/git.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
# Tracing
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
|
||||||
|
wxpropgrid = callPackage ./bsc/wxpropgrid/default.nix { };
|
||||||
|
paraver = callPackage ./bsc/paraver/default.nix { };
|
||||||
|
paraverExtra = bsc.paraver.override { enableMouseLabel = true; };
|
||||||
|
paraverDebug = bsc.paraver.overrideAttrs (old: {
|
||||||
|
dontStrip = true;
|
||||||
|
enableDebugging = true;
|
||||||
|
});
|
||||||
|
|
||||||
|
extrae = callPackage ./bsc/extrae/default.nix { };
|
||||||
|
otf = callPackage ./bsc/otf/default.nix { };
|
||||||
|
vite = self.qt5.callPackage ./bsc/vite/default.nix { };
|
||||||
|
babeltrace = callPackage ./bsc/babeltrace/default.nix { };
|
||||||
|
babeltrace2 = callPackage ./bsc/babeltrace2/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# Perf for MN4 kernel
|
||||||
|
perf = callPackage ./bsc/perf/default.nix {
|
||||||
|
kernel = self.linuxPackages_4_9.kernel;
|
||||||
|
systemtap = self.linuxPackages_4_9.systemtap;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
# MN4 specific
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
|
||||||
|
osumb = callPackage ./bsc/osu/default.nix { };
|
||||||
|
pmix2 = callPackage ./bsc/pmix/pmix2.nix { };
|
||||||
|
slurm17 = callPackage ./bsc/slurm/default.nix {
|
||||||
|
pmix = bsc.pmix2;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
slurm17-libpmi2 = callPackage ./bsc/slurm/pmi2.nix {
|
||||||
|
pmix = bsc.pmix2;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
# Use a slurm compatible with MN4
|
||||||
|
slurm = bsc.slurm17;
|
||||||
|
# Our custom version that lacks the binaries. Disabled by default.
|
||||||
|
#rdma-core = callPackage ./bsc/rdma-core/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
# Patched from upstream
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
|
||||||
|
groff = callPackage ./bsc/groff/default.nix { };
|
||||||
|
fftw = callPackage ./bsc/fftw/default.nix { };
|
||||||
|
vtk = callPackage ./bsc/vtk/default.nix {
|
||||||
|
inherit (self.xorg) libX11 xorgproto libXt;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
busybox = self.busybox.override {
|
busybox = self.busybox.override {
|
||||||
enableStatic = true;
|
enableStatic = true;
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
groff = callPackage ./bsc/groff/default.nix { };
|
# =================================================================
|
||||||
|
# Misc
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
|
||||||
|
dummy = callPackage ./bsc/dummy/default.nix { };
|
||||||
|
mpptest = callPackage ./bsc/mpptest/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
# Garlic benchmark
|
||||||
|
# =================================================================
|
||||||
|
|
||||||
nixtools = callPackage ./bsc/nixtools/default.nix { };
|
nixtools = callPackage ./bsc/nixtools/default.nix { };
|
||||||
|
|
||||||
@ -193,366 +198,13 @@ let
|
|||||||
# Aliases bsc.apps -> bsc.garlic.apps
|
# Aliases bsc.apps -> bsc.garlic.apps
|
||||||
inherit (bsc.garlic) apps fig exp ds;
|
inherit (bsc.garlic) apps fig exp ds;
|
||||||
|
|
||||||
# TODO: move into garlic/default.nix
|
garlic = import ./garlic/index.nix {
|
||||||
garlic = {
|
inherit self super bsc callPackage;
|
||||||
|
|
||||||
unsafeDevelop = callPackage ./garlic/develop/default.nix {
|
|
||||||
extraInputs = with self; [
|
|
||||||
coreutils htop procps-ng vim which strace
|
|
||||||
tmux gdb kakoune universal-ctags bashInteractive
|
|
||||||
glibcLocales ncurses git screen curl
|
|
||||||
# Add more nixpkgs packages here...
|
|
||||||
bsc.slurm bsc.clangOmpss2 bsc.icc bsc.mcxx bsc.perf
|
|
||||||
# Add more bscpkgs packages here...
|
|
||||||
];
|
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
develop = bsc.garlic.stages.exec rec {
|
# test = {
|
||||||
nextStage = bsc.garlic.stages.isolate {
|
# hwloc = callPackage ./test/bugs/hwloc.nix { };
|
||||||
nextStage = bsc.garlic.unsafeDevelop;
|
|
||||||
nixPrefix = bsc.garlic.targetMachine.config.nixPrefix;
|
|
||||||
extraMounts = [ "/tmp:$TMPDIR" ];
|
|
||||||
};
|
|
||||||
nixPrefix = bsc.garlic.targetMachine.config.nixPrefix;
|
|
||||||
# This hack uploads all dependencies to MN4
|
|
||||||
pre = let
|
|
||||||
nixPrefix = bsc.garlic.targetMachine.config.nixPrefix;
|
|
||||||
stageProgram = bsc.garlicTools.stageProgram;
|
|
||||||
in
|
|
||||||
''
|
|
||||||
# Hack to upload this to MN4: @upload-to-mn@
|
|
||||||
|
|
||||||
# Create a link to the develop script
|
|
||||||
ln -fs ${nixPrefix}${stageProgram nextStage} .nix-develop
|
|
||||||
'';
|
|
||||||
post = "\n";
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
# Configuration for the machines
|
|
||||||
machines = callPackage ./garlic/machines.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
report = callPackage ./garlic/report.nix {
|
|
||||||
fig = bsc.garlic.fig;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
sedReport = callPackage ./garlic/sedReport.nix {
|
|
||||||
fig = bsc.garlic.fig;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
bundleReport = callPackage ./garlic/bundleReport.nix {
|
|
||||||
fig = bsc.garlic.fig;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
reportTar = callPackage ./garlic/reportTar.nix {
|
|
||||||
fig = bsc.garlic.fig;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
# Use the configuration for the following target machine
|
|
||||||
targetMachine = bsc.garlic.machines.mn4;
|
|
||||||
|
|
||||||
# Load some helper functions to generate app variants
|
|
||||||
|
|
||||||
stdexp = callPackage ./garlic/stdexp.nix {
|
|
||||||
inherit (bsc.garlic) targetMachine stages;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
# Apps for Garlic
|
|
||||||
|
|
||||||
apps = {
|
|
||||||
|
|
||||||
nbody = callPackage ./garlic/apps/nbody/default.nix {
|
|
||||||
cc = bsc.icc;
|
|
||||||
mpi = bsc.mpi;
|
|
||||||
tampi = bsc.tampi;
|
|
||||||
mcxx = bsc.mcxx;
|
|
||||||
gitBranch = "garlic/seq";
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
saiph = callPackage ./garlic/apps/saiph/default.nix {
|
|
||||||
cc = bsc.clangOmpss2;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
creams = callPackage ./garlic/apps/creams/default.nix {
|
|
||||||
gnuDef = self.gfortran10 ; # Default GNU compiler version
|
|
||||||
intelDef = bsc.icc ; # Default Intel compiler version
|
|
||||||
gitBranch = "garlic/mpi+send+seq";
|
|
||||||
cc = bsc.icc; # bsc.icc OR self.gfortran10;
|
|
||||||
mpi = bsc.mpi; # bsc.mpi OR bsc.openmpi-mn4;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
creamsInput = callPackage ./garlic/apps/creams/input.nix {
|
|
||||||
gitBranch = "garlic/mpi+send+seq";
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
hpcg = callPackage ./garlic/apps/hpcg/default.nix {
|
|
||||||
cc = bsc.icc;
|
|
||||||
mcxx = bsc.mcxx;
|
|
||||||
nanos6 = bsc.nanos6;
|
|
||||||
gitBranch = "garlic/oss";
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
bigsort = {
|
|
||||||
sort = callPackage ./garlic/apps/bigsort/default.nix {
|
|
||||||
gitBranch = "garlic/mpi+send+omp+task";
|
|
||||||
cc = bsc.icc;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
genseq = callPackage ./garlic/apps/bigsort/genseq.nix {
|
|
||||||
cc = bsc.icc;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
shuffle = callPackage ./garlic/apps/bigsort/shuffle.nix {
|
|
||||||
cc = bsc.icc;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
heat = callPackage ./garlic/apps/heat/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
miniamr = callPackage ./garlic/apps/miniamr/default.nix {
|
|
||||||
variant = "ompss-2";
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
ifsker = callPackage ./garlic/apps/ifsker/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
lulesh = callPackage ./garlic/apps/lulesh/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
hpccg = callPackage ./garlic/apps/hpccg/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
fwi = callPackage ./garlic/apps/fwi/default.nix { };
|
|
||||||
|
|
||||||
# heat = callPackage ./garlic/apps/heat/default.nix {
|
|
||||||
# # FIXME: The heat program must be able to compile with gcc9 and newer
|
|
||||||
# stdenv = self.gcc7Stdenv;
|
|
||||||
# #mpi = intel-mpi;
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# #tampi = tampi;
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#
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# # FIXME: Nanos6 fails to load if we are not using a compatible stdc++
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# # version, so we use the same provided by gcc7
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||||||
# mcxx = bsc.mcxx.override {
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||||||
# nanos6 = bsc.nanos6.override {
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||||||
# stdenv = self.gcc7Stdenv;
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# };
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# };
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||||||
# };
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||||||
# };
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||||||
};
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||||||
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# Execution stages
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stages = {
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||||||
sbatch = callPackage ./garlic/stages/sbatch.nix { };
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||||||
srun = callPackage ./garlic/stages/srun.nix { };
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|
||||||
control = callPackage ./garlic/stages/control.nix { };
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|
||||||
exec = callPackage ./garlic/stages/exec.nix { };
|
|
||||||
extrae = callPackage ./garlic/stages/extrae.nix { };
|
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||||||
valgrind = callPackage ./garlic/stages/valgrind.nix { };
|
|
||||||
perf = callPackage ./garlic/stages/perf.nix { };
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||||||
isolate = callPackage ./garlic/stages/isolate { };
|
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||||||
runexp = callPackage ./garlic/stages/runexp { };
|
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||||||
trebuchet = callPackage ./garlic/stages/trebuchet.nix { };
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||||||
strace = callPackage ./garlic/stages/strace.nix { };
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||||||
unit = callPackage ./garlic/stages/unit.nix { };
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||||||
experiment = callPackage ./garlic/stages/experiment.nix { };
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||||||
};
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# Tests (move to bsc ?)
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mpptest = callPackage ./garlic/mpptest { };
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ppong = callPackage ./garlic/ppong {
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mpi = bsc.mpi;
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};
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hist = callPackage ./garlic/pp/hist { };
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tool = callPackage ./garlic/sh/default.nix {
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sshHost = "mn1";
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};
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# Post processing tools
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pp = with bsc.garlicTools; rec {
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store = callPackage ./garlic/pp/store.nix { };
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||||||
resultFromTrebuchet = trebuchetStage: (store {
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experimentStage = getExperimentStage trebuchetStage;
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||||||
inherit trebuchetStage;
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||||||
});
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||||||
timetable = callPackage ./garlic/pp/timetable.nix { };
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||||||
rPlot = callPackage ./garlic/pp/rplot.nix { };
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||||||
timetableFromTrebuchet = tre: timetable (resultFromTrebuchet tre);
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||||||
mergeDatasets = callPackage ./garlic/pp/merge.nix { };
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||||||
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||||||
# Takes a list of experiments and returns a file that contains
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# all timetable results from the experiments.
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merge = exps: mergeDatasets (map timetableFromTrebuchet exps);
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};
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# Experiments
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exp = {
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nbody = rec {
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baseline = callPackage ./garlic/exp/nbody/nblocks.nix { };
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||||||
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||||||
# Experiment variants
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small = baseline.override {
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particles = 12 * 4096;
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};
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# TODO: Update freeCpu using a non-standard pipeline
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#freeCpu = baseline.override { freeCpu = true; };
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jemalloc = baseline.override { enableJemalloc = true; };
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# Some experiments with traces
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trace = {
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# Only one unit repeated 30 times
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baseline = small.override {
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||||||
enableCTF = true;
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||||||
loops = 30;
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||||||
steps = 1;
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||||||
};
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||||||
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||||||
# Same but with jemalloc enabled
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||||||
jemalloc = trace.baseline.override {
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enableJemalloc = true;
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||||||
};
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||||||
};
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|
||||||
};
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||||||
|
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||||||
saiph = {
|
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||||||
numcomm = callPackage ./garlic/exp/saiph/numcomm.nix { };
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||||||
granularity = callPackage ./garlic/exp/saiph/granularity.nix { };
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
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||||||
creams = {
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||||||
ss = {
|
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||||||
pure = callPackage ./garlic/exp/creams/ss+pure.nix { };
|
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||||||
hybrid = callPackage ./garlic/exp/creams/ss+hybrid.nix { };
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
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||||||
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||||||
hpcg = rec {
|
|
||||||
#serial = callPackage ./garlic/exp/hpcg/serial.nix { };
|
|
||||||
#mpi = callPackage ./garlic/exp/hpcg/mpi.nix { };
|
|
||||||
#omp = callPackage ./garlic/exp/hpcg/omp.nix { };
|
|
||||||
#mpi_omp = callPackage ./garlic/exp/hpcg/mpi+omp.nix { };
|
|
||||||
#input = callPackage ./garlic/exp/hpcg/gen.nix {
|
|
||||||
# inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
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|
||||||
#};
|
|
||||||
genInput = callPackage ./garlic/exp/hpcg/gen.nix {
|
|
||||||
inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
oss = callPackage ./garlic/exp/hpcg/oss.nix {
|
|
||||||
inherit genInput;
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|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
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||||||
heat = {
|
|
||||||
test = callPackage ./garlic/exp/heat/test.nix { };
|
|
||||||
};
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||||||
|
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||||||
bigsort = rec {
|
|
||||||
genseq = callPackage ./garlic/exp/bigsort/genseq.nix {
|
|
||||||
n = toString (1024 * 1024 * 1024 / 8); # 1 GB input size
|
|
||||||
dram = toString (1024 * 1024 * 1024); # 1 GB chunk
|
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||||||
};
|
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||||||
|
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||||||
shuffle = callPackage ./garlic/exp/bigsort/shuffle.nix {
|
|
||||||
inputTre = genseq;
|
|
||||||
n = toString (1024 * 1024 * 1024 / 8); # 1 GB input size
|
|
||||||
dram = toString (1024 * 1024 * 1024); # 1 GB chunk
|
|
||||||
inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
sort = callPackage ./garlic/exp/bigsort/sort.nix {
|
|
||||||
inputTre = shuffle;
|
|
||||||
inherit (bsc.garlic.pp) resultFromTrebuchet;
|
|
||||||
removeOutput = false;
|
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||||||
};
|
|
||||||
};
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||||||
|
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||||||
slurm = {
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||||||
cpu = callPackage ./garlic/exp/slurm/cpu.nix { };
|
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||||||
};
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||||||
};
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||||||
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||||||
allExperiments = self.writeText "experiments.json"
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||||||
(builtins.toJSON bsc.garlic.exp);
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# Datasets used in the figures
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||||||
ds = with bsc.garlic; with pp; {
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||||||
nbody = with exp.nbody; {
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||||||
baseline = merge [ baseline ];
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||||||
small = merge [ small ];
|
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||||||
jemalloc = merge [ baseline jemalloc ];
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||||||
#freeCpu = merge [ baseline freeCpu ];
|
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||||||
ctf = merge [ ctf ];
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
hpcg = with exp.hpcg; {
|
|
||||||
oss = merge [ oss ];
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
saiph = with exp.saiph; {
|
|
||||||
numcomm = merge [ numcomm ];
|
|
||||||
granularity = merge [ granularity ];
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
heat = with exp.heat; {
|
|
||||||
test = merge [ test ];
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
creams = with exp.creams.ss; {
|
|
||||||
ss.hybrid = merge [ hybrid ];
|
|
||||||
ss.pure = merge [ pure ];
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
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||||||
# Figures generated from the experiments
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||||||
fig = with bsc.garlic; {
|
|
||||||
nbody = {
|
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||||||
baseline = pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/nbody/baseline.R;
|
|
||||||
dataset = ds.nbody.baseline;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
small = pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/nbody/baseline.R;
|
|
||||||
dataset = ds.nbody.small;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
jemalloc = pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/nbody/jemalloc.R;
|
|
||||||
dataset = ds.nbody.jemalloc;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
#freeCpu = pp.rPlot {
|
|
||||||
# script = ./garlic/fig/nbody/freeCpu.R;
|
|
||||||
# dataset = ds.nbody.freeCpu;
|
|
||||||
#};
|
|
||||||
ctf = pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/nbody/baseline.R;
|
|
||||||
dataset = ds.nbody.ctf;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
hpcg = {
|
|
||||||
oss = with ds.hpcg; pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/hpcg/oss.R;
|
|
||||||
dataset = oss;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
saiph = {
|
|
||||||
granularity = with ds.saiph; pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/saiph/granularity.R;
|
|
||||||
dataset = granularity;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
heat = {
|
|
||||||
test = with ds.heat; pp.rPlot {
|
|
||||||
script = ./garlic/fig/heat/test.R;
|
|
||||||
dataset = test;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
test = {
|
|
||||||
hwloc = callPackage ./test/bugs/hwloc.nix { };
|
|
||||||
};
|
|
||||||
};
|
|
||||||
});
|
});
|
||||||
|
|
||||||
in
|
in
|
||||||
|
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